作者用的是佛家理论，借如来的口，以寓言的形式写的，可能不好理解。简单的说就是六耳就是孙悟空变的，两个悟空都是悟空，只是他自己不知道。
如果按照阴谋论，孙悟空拔一撮毫毛，变成千万个悟空，怎么证明最后剩下的是原来的那个悟空？
如果如来不瞎编出个六耳猕猴，那前面打伤唐僧，抢了行李，变出假唐僧假八戒假沙僧的，都是孙悟空自己，这个账唐僧八戒沙僧要怎么跟孙悟空算？所以孙悟空要急急忙忙打死他，也是自己撇清干系。
孙悟空此时已经顿悟了，如来给他个台阶，让他回去能跟唐僧交代。有没有四猴混世，孙悟空会不知道吗，猴类的生死簿就是他毁的。
大众一发上前，把钵盂揭起，果然见了本象，是一个六耳猕猴。孙大圣忍不住，轮起铁棒，劈头一下打死，至今绝此一种。如来不忍，道声：“善哉，善哉！”大圣道：“如来不该慈悯他，他打伤我师父，抢夺我包袱，依律问他个得财伤人，白昼抢夺，也该个斩罪哩！”如来道：“你自快去保护唐僧来此求经罢。”大圣叩头谢道：“上告如来得知，那师父定是不要我，我此去，若不收留，却不又劳一番神思！望如来方便，把松箍儿咒念一念，褪下这个金箍，交还如来，放我还俗去罢。”如来道：“你休乱想，切莫放刁。我教观音送你去，不怕他不收。好生保护他去，那时功成归极乐，汝亦坐莲台。”
你看这里就是两个人心知肚明是怎么回事，但还是互相逗闷子，此时孙悟空已经脱了凡胎顿悟成佛了，没有继续修行的必要了，剩下的取经算是赠送的，因为还得让唐僧成佛。
孙悟空被赶走，本来就是师徒误会一场，悟空没错，唐僧也没错，互相斗气，解开误会就好了。但是假悟空把唐僧揍了一顿，搞了一套假取经队，这个性质变了，这是欺师灭祖，撕破脸了。如果如来不让观音去作保，他们师徒是不可能和好的。悟空打死自己以后，还要从如来这里要来一个保证，这事既往不咎，到时候坐莲台，该成佛就成佛，不会秋后算账。
唐僧却要到无底船那里看到自己的死尸，才算成佛。孙悟空不管是慧根，还是佛家理论，都比唐僧高的多。唐僧看到死尸那里的诗这样说，脱却胎胞骨肉身，相亲相爱是元神。今朝行满方成佛，洗净当年六六尘。所谓六六，就是六识六欲。六耳就是六识，眼耳鼻舌身意，色声香味触法，他编一个叫六眼马猴，六鼻金丝猴，六舌银背大猩猩，都是一个意思。如来一说六耳，孙悟空马上就顿悟了。
取经队伍里一共只有两人成佛，一个旃檀功德佛，一个斗战胜佛。斗战胜佛就是靠一棒子打死自己来成佛的，旃檀功德佛是在无底船被孙悟空推下水里，淹死成佛的。成佛就是这么简单粗暴。可以说这取经一路上，都是孙悟空在教导唐僧，激励唐僧。最后成佛也是悟空推着成佛。
看了下大家的回答，原来作者还给了茫茫多的暗示啊，主要有
1，斜月三星洞里，悟空说此处更无六耳。灵台方寸山，斜月三星，都是个心字，从此悟空就是心猿。
2，孙悟空刚被唐僧剃度后，打死了眼耳鼻舌身意六个毛贼，和打死六耳是一个原理。六个毛贼的名字是眼看喜，耳听怒，鼻嗅爱，舌尝思，意见欲，身本忧。他们的名字就是六识和六欲。
3，如来说汝等是一心，看二心争斗而来。
唐僧就是一个作逼，揍一顿就治好了，后面路上老老实实，连紧箍咒都没念过。

其实我觉得知乎上的这些还挺有意思的

0几年来着？猫扑上就有了。

最后一行好笑

据说孙悟空死了。

六耳猕猴

唐僧就是一个作逼，揍一顿就治好了，后面路上老老实实，连紧箍咒都没念过。

哈哈哈哈哈，这句话成功的逗笑了我。